« Le plus grand aquarium du monde », comme le surnommait Jacques-Yves Cousteau, abrite une faune exceptionnelle. La meilleure façon de l’observer reste la plongée sous-marine (pour plongeurs confirmés) sur des sites nombreux et riches en surprises, dont les noms laissent rêveur : île Monserrat, île Coronado, Punta Colorada et Bahia Amortajada sur l’île San Jose, île Espíritu Santo, île Cerralvo… 39% des espèces de mammifères marins connus sur terre, 900 espèces de poissons et 33 de cétacés évoluent ici. Grands dauphins, baleines grises et bleues, requins marteaux, requins-baleines, otaries ou tortues ont été recensés dans la région.